El Dr. Aguayo es Cirujano Dentista de la Facultad de Odontología, Universidad de Concepción, Chile y tiene un doctorado (PhD) en Biomateriales del Eastman Dental Institute, University College London (UCL), Reino Unido. Su actual línea de investigación se centra en la exploración de las interacciones de adhesión iniciales entre bacterias y superficies en el contexto de la formación de biopelículas, tanto a nivel celular como subcelular, utilizando una combinación de técnicas macro- y nano-escala.
Actualmente es Profesor Asistente de la Escuela de Odontología y del Instituto de Ingeniería Biológica y Médica UC.